在常见鱼病中，往往有的症状相似，而病原体不同，必须加以区别，才能对症下药：
一、病毒性肠炎与细菌性肠炎。病鱼肠管均呈红色，但病毒引起的还兼有口腔、肌肉、鳃盖、鳍条等充血现象， 肠粘膜皮肤一般不腐烂脱落；而细菌性肠炎，没有口腔肌肉充血现象， 但肠道粘膜往往溃烂化浓，乳黄色的腹水很多。
一、病毒性肠炎与细菌性肠炎。病鱼肠管均呈红色，但病毒引起的还兼有口腔、肌肉、鳃盖、鳍条等充血现象， 肠粘膜皮肤一般不腐烂脱落；而细菌性肠炎，没有口腔肌肉充血现象， 但肠道粘膜往往溃烂化浓，乳黄色的腹水很多。
二、具白点症状的鱼病。包括白皮病、打粉病(白鳞病)、 小瓜虫病及微孢子虫病。后两种的主要区别是，病鱼死后2～3小时，观察其发病部位， 仍有白点的是由微孢子虫引起的，没有则是小瓜虫引起的。 前两种病的区别：背鳍、尾鳍及背部先后出现白点，但随病情加剧，白点数目不断增多，最终白点遍及全身，使整个体表似擦了一层白色粉末，此是打粉病。 而白皮病白点只出现于背鳍基部或尾柄处，病情发展也只是白点本身的面积扩大， 最终表现为以背鳍至臀鳍为界的整个后部皮肤呈白色。寄生于体表的小瓜虫与打粉病白点的主要区别是：前者细看白点间有充血的红斑。
三、“鳃盖张开”状鱼病。包括车轮虫病和指坏虫病等。前者具有典型的“白头白嘴”，鳃丝鲜红等状；后者则鳃丝呈暗蓝色，鳃部明显浮肿。
四、“肠壁膨大”状鱼病。球虫病、许氏绦虫病、九江头槽绦虫病、刺棘虫病、新棘吻虫病及鲤棘吻虫病等， 不同程度的肠壁膨大或肠道堵塞等症状。 但侧殖吸虫病和九江头槽绦虫病分别有闭口不吃食和口常张开不吃食的明显症状与其它病相区别。球虫主要寄生于青鱼。许氏绦虫和鲤长棘吻虫均只寄生于鲤鱼，但后者一般是寄生于前肠，严重时肠管发炎、 肿胀和溃疡，肠壁穿孔。刺棘吻虫主要危害草鱼。
